194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2766 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  67.42 
 
 		 487 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 492 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  89.07 
 
 		 499 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  41.83 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  40.86 
 
 		 602 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 611 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 		 545 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 536 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 		 607 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  35.48 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  36.61 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.39 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 588 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 602 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  38.27 
 
 		 600 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 496 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.75 
 
 		 1077 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 571 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 593 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 573 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.11 
 
 		 653 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 653 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.27 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 601 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 542 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 1450 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 598 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  35.83 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  35.83 
 
 		 711 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 556 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 608 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1212 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  31.59 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  32.69 
 
 		 387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 		 689 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1005 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 578 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  30.31 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.84 
 
 		 1034 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 574 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 1038 aa  157  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 546 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 558 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 649 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 649 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 955 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 607 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.23 
 
 		 714 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.98 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 3145 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.28 
 
 		 760 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 595 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 646 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 688 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 577 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 502 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 502 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1451 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 935 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.43 
 
 		 1677 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.56 
 
 		 872 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 780 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.06 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.89 
 
 		 1764 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.3 
 
 		 648 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 740 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 767 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  30.48 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 		 509 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  28.1 
 
 		 630 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 636 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 747 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  29.69 
 
 		 703 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 1073 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2193  hypothetical protein  34.08 
 
 		 552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2057  hypothetical protein  34.08 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>