262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2740 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  100 
 
 
158 aa  323  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  86.71 
 
 
158 aa  290  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  86.71 
 
 
159 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  84.81 
 
 
159 aa  283  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  83.54 
 
 
224 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  82.91 
 
 
180 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  82.91 
 
 
158 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  82.28 
 
 
158 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  81.65 
 
 
158 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  81.01 
 
 
158 aa  274  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  81.01 
 
 
158 aa  273  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  81.01 
 
 
158 aa  273  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  81.01 
 
 
158 aa  273  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  79.74 
 
 
159 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  75.32 
 
 
159 aa  247  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  75.32 
 
 
159 aa  247  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  73.42 
 
 
159 aa  243  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  72.78 
 
 
159 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  72.78 
 
 
159 aa  237  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  68.99 
 
 
158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  70.78 
 
 
158 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  70.78 
 
 
158 aa  231  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  70.13 
 
 
158 aa  229  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  70.13 
 
 
158 aa  229  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  69.62 
 
 
158 aa  228  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  69.03 
 
 
158 aa  227  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  68.83 
 
 
159 aa  223  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  66.23 
 
 
158 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  67.95 
 
 
159 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  69.74 
 
 
158 aa  217  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  65.58 
 
 
158 aa  216  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  63.29 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  64.56 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  66.23 
 
 
157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  68.39 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  65.82 
 
 
160 aa  210  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  209  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  66.46 
 
 
158 aa  207  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  63.29 
 
 
159 aa  206  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  66.23 
 
 
157 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  66.23 
 
 
157 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  65.81 
 
 
156 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  66.88 
 
 
157 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  64.29 
 
 
154 aa  204  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  65.58 
 
 
157 aa  203  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  63.92 
 
 
159 aa  202  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  63.16 
 
 
158 aa  201  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  61.04 
 
 
154 aa  200  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  59.49 
 
 
159 aa  197  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  63.16 
 
 
172 aa  196  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  63.64 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  63.64 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  66.88 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  61.04 
 
 
159 aa  194  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  64.94 
 
 
156 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  64.94 
 
 
156 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  60.39 
 
 
159 aa  191  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  61.18 
 
 
157 aa  191  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  58.33 
 
 
162 aa  188  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  59.62 
 
 
157 aa  188  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  59.62 
 
 
157 aa  187  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  56.33 
 
 
159 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  56.77 
 
 
156 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  56.77 
 
 
156 aa  185  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  59.87 
 
 
158 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  60.53 
 
 
158 aa  183  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  60.53 
 
 
158 aa  183  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  60.53 
 
 
158 aa  183  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  60.53 
 
 
158 aa  183  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  59.21 
 
 
158 aa  183  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  60.53 
 
 
158 aa  183  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  58.55 
 
 
154 aa  183  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  59.33 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  59.33 
 
 
154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  55.41 
 
 
168 aa  180  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  57.24 
 
 
157 aa  180  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  57.24 
 
 
157 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  57.24 
 
 
157 aa  177  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  57.24 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  56.49 
 
 
154 aa  176  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3608  bacterioferritin  59.35 
 
 
156 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0944  bacterioferritin  58.55 
 
 
157 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0982  bacterioferritin  58.55 
 
 
157 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3358  bacterioferritin  57.89 
 
 
157 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000472947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>