More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2651 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  100 
 
 		 348 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  95.74 
 
 		 352 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  84.29 
 
 		 350 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  79.6 
 
 		 343 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  79.6 
 
 		 343 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  79.89 
 
 		 343 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  78.67 
 
 		 343 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  78.67 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  78.96 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  78.96 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  75.29 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 		 382 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 		 342 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 		 342 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  74.71 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  74.71 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  74.71 
 
 		 342 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  74.71 
 
 		 342 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  64.49 
 
 		 359 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  63.35 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  62.5 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  57.69 
 
 		 361 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  56.18 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  56.76 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  56.08 
 
 		 353 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  52.2 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  52 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  51.3 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  51.01 
 
 		 353 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.26 
 
 		 370 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  49.52 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.51 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.73 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  48.25 
 
 		 353 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.8 
 
 		 352 aa  281  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  49.36 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.03 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 		 359 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.1 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  50.97 
 
 		 361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  56.67 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  47.89 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.18 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  45.32 
 
 		 341 aa  265  5.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.54 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 		 353 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.34 
 
 		 354 aa  263  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  40.17 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  45.15 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.24 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.95 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 347 aa  261  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 376 aa  261  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.62 
 
 		 373 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.88 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  44.66 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.75 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.51 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.5 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.81 
 
 		 377 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.82 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.95 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  47.21 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50.17 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.91 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  46.6 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.25 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  53.75 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.44 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.6 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  47.2 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.58 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.98 
 
 		 342 aa  256  5e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  46.25 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  53.94 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.2 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.2 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.39 
 
 		 372 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.2 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.2 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.2 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>