More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2612 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  62.48 
 
 
732 aa  887    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  62.48 
 
 
782 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  63.49 
 
 
704 aa  859    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  63.23 
 
 
748 aa  880    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
699 aa  1420    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  67.58 
 
 
694 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  63.73 
 
 
721 aa  865    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.96 
 
 
702 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.99 
 
 
707 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.57 
 
 
721 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.73 
 
 
721 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.42 
 
 
703 aa  837    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  63.19 
 
 
698 aa  883    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  62.48 
 
 
772 aa  887    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  62.48 
 
 
776 aa  889    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  62.48 
 
 
776 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  63.19 
 
 
698 aa  883    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  43.37 
 
 
696 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  45.77 
 
 
684 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  45.83 
 
 
685 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  44.35 
 
 
681 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  45.43 
 
 
741 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  44.7 
 
 
695 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  43.61 
 
 
711 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.31 
 
 
698 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  43.99 
 
 
676 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  45.25 
 
 
702 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  43.11 
 
 
663 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  43.07 
 
 
673 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  43.11 
 
 
663 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  43.11 
 
 
663 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  44.37 
 
 
711 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  42.67 
 
 
681 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  41.55 
 
 
697 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  41.84 
 
 
697 aa  485  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  39.45 
 
 
697 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  38.14 
 
 
695 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  39.39 
 
 
696 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.07 
 
 
689 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  40.78 
 
 
676 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  37.85 
 
 
697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  40.77 
 
 
718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  38.62 
 
 
701 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  38.28 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  37.7 
 
 
697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  37.85 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  38.28 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  35.86 
 
 
710 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.26 
 
 
697 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  38.28 
 
 
697 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.25 
 
 
696 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.71 
 
 
712 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  39.26 
 
 
722 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.97 
 
 
691 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.22 
 
 
770 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.53 
 
 
767 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  36.23 
 
 
793 aa  419  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  39.48 
 
 
734 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  38.45 
 
 
688 aa  415  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.37 
 
 
691 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  34.01 
 
 
680 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  33.86 
 
 
680 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  39.44 
 
 
726 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  42.38 
 
 
1283 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  46.67 
 
 
704 aa  225  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  43.09 
 
 
692 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  41.39 
 
 
730 aa  217  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  43.01 
 
 
708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  42.61 
 
 
723 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  41.72 
 
 
719 aa  214  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  40.4 
 
 
701 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  38.56 
 
 
703 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  46.96 
 
 
690 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  43.91 
 
 
711 aa  211  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  45.45 
 
 
703 aa  211  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  47.28 
 
 
713 aa  211  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  39.68 
 
 
714 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  41.18 
 
 
685 aa  209  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  41.45 
 
 
677 aa  209  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  38.44 
 
 
688 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  38.44 
 
 
688 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  38.89 
 
 
689 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  39.79 
 
 
679 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  35.2 
 
 
727 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  35.2 
 
 
727 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  43.87 
 
 
709 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  25.75 
 
 
685 aa  204  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
727 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  37.62 
 
 
719 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
727 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  38.11 
 
 
670 aa  204  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  34.64 
 
 
727 aa  203  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  34.25 
 
 
719 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
727 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  34.92 
 
 
727 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  34.64 
 
 
726 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  38.44 
 
 
688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  41.57 
 
 
695 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  39.94 
 
 
745 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  46.4 
 
 
705 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>