More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2611 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 258 aa  533  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  96.51 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  85.88 
 
 		 258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  75.97 
 
 		 258 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  76.36 
 
 		 258 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  76.74 
 
 		 258 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  76.74 
 
 		 258 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  75.69 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  75.97 
 
 		 272 aa  424  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  75.69 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 322 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  73.26 
 
 		 258 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  74.42 
 
 		 258 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  65.78 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  65.79 
 
 		 269 aa  362  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  66.41 
 
 		 265 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  63.91 
 
 		 269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  63.53 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  62.32 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  63.18 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  60.85 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  58.91 
 
 		 288 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  59.92 
 
 		 254 aa  321  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  59.69 
 
 		 256 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  58.53 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  58.4 
 
 		 258 aa  311  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  54.65 
 
 		 277 aa  308  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  58.24 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  57.75 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  54.47 
 
 		 256 aa  298  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  54.86 
 
 		 267 aa  298  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  54.86 
 
 		 256 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  56.11 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  55.21 
 
 		 258 aa  294  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  56.11 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  54.86 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  54.65 
 
 		 255 aa  291  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 267 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  55.81 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  55.81 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  56.92 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  53.31 
 
 		 256 aa  284  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  56.87 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  50.98 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  52.9 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  52.51 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  52.12 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  48.45 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  46.15 
 
 		 260 aa  252  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  47.3 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  45.42 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  46.18 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  45.38 
 
 		 260 aa  237  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  42.8 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  44.11 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  49.03 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  49.03 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  43.02 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  43.89 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  41.29 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  40.07 
 
 		 281 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  43.13 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  41.83 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  41.83 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  43.89 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  41.73 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  41.44 
 
 		 275 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  44.27 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  42.53 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  43.3 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  43.51 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  43.92 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  44.96 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  43.41 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  43.85 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  43.24 
 
 		 303 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  44.91 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  43.35 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  40.75 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  43.46 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  41.25 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  41.13 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  45.88 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  44.49 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  44.66 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  41.83 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>