206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2396 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  100 
 
 
655 aa  1216    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  59.59 
 
 
575 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  56.76 
 
 
589 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  58.71 
 
 
536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  47.18 
 
 
597 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  47.51 
 
 
597 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  47.51 
 
 
597 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  35.94 
 
 
877 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  39.56 
 
 
898 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  34.55 
 
 
810 aa  190  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  37.96 
 
 
2505 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.17 
 
 
1072 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  36.65 
 
 
737 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  36.09 
 
 
1012 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  35.12 
 
 
1654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  36.42 
 
 
617 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  37.12 
 
 
827 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  42.42 
 
 
1417 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  38.19 
 
 
4384 aa  173  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  37.73 
 
 
2866 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  37.7 
 
 
1068 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  34.68 
 
 
715 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.68 
 
 
1535 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  34.68 
 
 
1626 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  34.68 
 
 
1766 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  34.88 
 
 
1705 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  34.68 
 
 
1669 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.89 
 
 
1117 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  36.57 
 
 
2814 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  40.11 
 
 
1090 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  40 
 
 
1074 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  40.11 
 
 
1090 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  40.11 
 
 
1090 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  40.11 
 
 
1122 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  40.11 
 
 
1122 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  40.11 
 
 
1122 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  36.77 
 
 
2728 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  36.77 
 
 
2778 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  39.93 
 
 
967 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  38.3 
 
 
472 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  40.31 
 
 
977 aa  160  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  35.63 
 
 
2025 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  30.63 
 
 
1230 aa  159  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  36.31 
 
 
691 aa  157  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  34.53 
 
 
831 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  36.07 
 
 
2757 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  34.53 
 
 
831 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1946  putative cell surface protein  36.07 
 
 
1916 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  38.1 
 
 
831 aa  154  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  39.67 
 
 
1190 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  37.31 
 
 
816 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  37.31 
 
 
816 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  37.31 
 
 
820 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  37.31 
 
 
816 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  37.31 
 
 
816 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  39.67 
 
 
1440 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  37.33 
 
 
2504 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  39.27 
 
 
1197 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  37.06 
 
 
1390 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  38.61 
 
 
1204 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  39.27 
 
 
1197 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  39.27 
 
 
1197 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  34.43 
 
 
548 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  38.61 
 
 
1125 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  35.98 
 
 
1065 aa  147  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  35.39 
 
 
1333 aa  145  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  37.95 
 
 
1451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  35.6 
 
 
2868 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  31.85 
 
 
1916 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  34.61 
 
 
716 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  32.9 
 
 
1411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  32.5 
 
 
572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  33.39 
 
 
650 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  35.68 
 
 
2141 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  29.51 
 
 
601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  33.9 
 
 
716 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  36.52 
 
 
1326 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  33.44 
 
 
600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  38.75 
 
 
3126 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  41 
 
 
3192 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  30.24 
 
 
1265 aa  126  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2042  putative cell surface protein  34.79 
 
 
365 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  35.74 
 
 
601 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  37.9 
 
 
2832 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  36.84 
 
 
3635 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  49.72 
 
 
423 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  36.67 
 
 
330 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  37.74 
 
 
2396 aa  124  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  36.86 
 
 
735 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.15 
 
 
880 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.73 
 
 
876 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  46.26 
 
 
2493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  31.63 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  29.95 
 
 
1549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  27.77 
 
 
1616 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  27.2 
 
 
1616 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  27.68 
 
 
1674 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  27.2 
 
 
1616 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  39.53 
 
 
990 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.61 
 
 
1588 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>