206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2395 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  63.82 
 
 
1117 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  100 
 
 
2141 aa  3940    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  62.18 
 
 
1471 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  62.18 
 
 
1471 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  62.38 
 
 
1546 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  63.74 
 
 
1353 aa  532  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  63.55 
 
 
1434 aa  529  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  53.18 
 
 
2396 aa  448  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  68.88 
 
 
1487 aa  304  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  35.04 
 
 
1342 aa  298  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  35.04 
 
 
1447 aa  298  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  34.91 
 
 
1447 aa  296  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  34.67 
 
 
1446 aa  297  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  34.31 
 
 
1472 aa  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  39.26 
 
 
4726 aa  289  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  35.25 
 
 
1122 aa  274  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  35.09 
 
 
1090 aa  272  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  35.25 
 
 
1074 aa  272  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  35.09 
 
 
1122 aa  272  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  35.09 
 
 
1090 aa  272  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  35.09 
 
 
1090 aa  272  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  35.25 
 
 
1122 aa  272  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  57.2 
 
 
330 aa  246  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  34.12 
 
 
1674 aa  229  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  33.59 
 
 
1616 aa  225  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.44 
 
 
1588 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  45.71 
 
 
1326 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.87 
 
 
1549 aa  216  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  65.13 
 
 
1766 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  65.13 
 
 
1626 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  65.13 
 
 
1669 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  65.13 
 
 
1535 aa  214  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  67.12 
 
 
1705 aa  214  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  44.95 
 
 
2814 aa  212  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.28 
 
 
1616 aa  211  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.28 
 
 
1616 aa  211  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  40.04 
 
 
4384 aa  210  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  41.87 
 
 
2866 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  43.94 
 
 
2778 aa  203  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  43.94 
 
 
2728 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  46.83 
 
 
1654 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  42.2 
 
 
898 aa  197  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  55.38 
 
 
373 aa  196  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  55.38 
 
 
373 aa  196  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  55.38 
 
 
378 aa  197  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  55.73 
 
 
192 aa  196  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  55.73 
 
 
192 aa  196  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  56.82 
 
 
2493 aa  195  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.21 
 
 
1309 aa  193  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  54.69 
 
 
533 aa  192  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  40.69 
 
 
716 aa  191  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  37.79 
 
 
753 aa  186  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  40.04 
 
 
716 aa  186  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  52.08 
 
 
378 aa  183  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  35.59 
 
 
3635 aa  183  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  52.08 
 
 
460 aa  182  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
816 aa  174  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
816 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
816 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
816 aa  174  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
831 aa  174  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
831 aa  174  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  38.14 
 
 
820 aa  174  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  37.71 
 
 
831 aa  171  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  33.24 
 
 
880 aa  171  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  52.85 
 
 
962 aa  171  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  52.85 
 
 
1012 aa  170  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  35.46 
 
 
878 aa  170  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  52.97 
 
 
1186 aa  170  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  52.85 
 
 
1068 aa  169  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.54 
 
 
2095 aa  168  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  32.87 
 
 
876 aa  168  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  49.15 
 
 
715 aa  163  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  37.24 
 
 
827 aa  162  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  42.28 
 
 
4191 aa  162  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  29.54 
 
 
3192 aa  161  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  35.32 
 
 
2157 aa  160  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  42.16 
 
 
3718 aa  158  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  32.96 
 
 
877 aa  158  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  46.84 
 
 
525 aa  157  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 
1613 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  58.96 
 
 
977 aa  153  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28 
 
 
1516 aa  153  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  42.11 
 
 
3355 aa  152  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  37.83 
 
 
737 aa  152  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  57.79 
 
 
2505 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  34.9 
 
 
617 aa  150  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  31.75 
 
 
1713 aa  149  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  37.06 
 
 
472 aa  145  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  26.98 
 
 
1230 aa  141  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  27.36 
 
 
1065 aa  141  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  39.78 
 
 
740 aa  137  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  39.78 
 
 
766 aa  137  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  37.82 
 
 
575 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  30.44 
 
 
691 aa  137  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  48.75 
 
 
1616 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1951  membrane-anchored cell surface protein  48.75 
 
 
1608 aa  133  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  45.4 
 
 
2025 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  48.75 
 
 
459 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  48.75 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>