More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2228 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  100 
 
 
416 aa  832    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  71.39 
 
 
416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  69.47 
 
 
416 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  69.23 
 
 
416 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  69.71 
 
 
416 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  69.47 
 
 
416 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  68.75 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  68.75 
 
 
435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  70.43 
 
 
416 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  69.12 
 
 
422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  69.23 
 
 
422 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  67.54 
 
 
420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  67.3 
 
 
420 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  67.3 
 
 
577 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  67.3 
 
 
420 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  67.3 
 
 
420 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  67.3 
 
 
420 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  67.3 
 
 
420 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  66.83 
 
 
471 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  56.18 
 
 
438 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  51.17 
 
 
432 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  45.16 
 
 
420 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  45.39 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  43.27 
 
 
419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  43.99 
 
 
420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  40.44 
 
 
423 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  40.68 
 
 
424 aa  332  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  40.44 
 
 
423 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  42.37 
 
 
421 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  40.19 
 
 
423 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  44 
 
 
425 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  40.92 
 
 
421 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  39.71 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  44.21 
 
 
417 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  39.37 
 
 
428 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  46.45 
 
 
443 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  43.51 
 
 
417 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  43.78 
 
 
417 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  39.71 
 
 
421 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  43.13 
 
 
421 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  42.93 
 
 
417 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  42.48 
 
 
417 aa  316  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  44.31 
 
 
416 aa  312  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  42.55 
 
 
419 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  40.68 
 
 
421 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  44.31 
 
 
418 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  40.67 
 
 
418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  41.69 
 
 
415 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  42.21 
 
 
415 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  40.24 
 
 
437 aa  292  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  40.24 
 
 
415 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  36.96 
 
 
419 aa  288  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  40.44 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  43.17 
 
 
415 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  33.1 
 
 
425 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  32.37 
 
 
425 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  32.86 
 
 
425 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  36.47 
 
 
420 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  31.88 
 
 
423 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  35.75 
 
 
412 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  32.13 
 
 
423 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  37.14 
 
 
414 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  36.5 
 
 
414 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  28.45 
 
 
450 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  31.2 
 
 
452 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  28.08 
 
 
454 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  29.93 
 
 
450 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.77 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  30.22 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  30.43 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  30.43 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  26.73 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  30.22 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  30.22 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  29.93 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  31.81 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  30.22 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  30.22 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  30.22 
 
 
450 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  29.72 
 
 
450 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  31.9 
 
 
455 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.72 
 
 
450 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  29.78 
 
 
450 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  30.59 
 
 
475 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.03 
 
 
450 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  26.17 
 
 
490 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  26.17 
 
 
490 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  26.17 
 
 
490 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.77 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  25.96 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  28.01 
 
 
449 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  28.6 
 
 
456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  30.95 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  28.01 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.33 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  31.99 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>