More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2140 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2140  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0104  LysR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 314 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1227  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2428  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.886071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0826  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.325124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0343  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0706  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0723  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 367 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 367 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0796  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  38.62 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3919  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2696  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5488  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 571 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3766  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3757  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4606  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3634  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.52 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4973  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 354 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 354 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  32.65 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000735562  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2342  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3212  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>