263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2108 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  68.98 
 
 
246 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  73.45 
 
 
242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  73.56 
 
 
246 aa  316  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  66.67 
 
 
227 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  48.43 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  51.28 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  51.14 
 
 
263 aa  207  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  48.46 
 
 
263 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  48.46 
 
 
263 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  47.84 
 
 
268 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  50.23 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  44.31 
 
 
263 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  50.24 
 
 
261 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  49.76 
 
 
262 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  45.06 
 
 
254 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  47.15 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  41.48 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  38.63 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  35.96 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  36.14 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  39.22 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  38 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  38.35 
 
 
243 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.88 
 
 
251 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  37.07 
 
 
246 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  38.31 
 
 
259 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  37.23 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  36.68 
 
 
258 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.81 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  35.38 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  35 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  35.37 
 
 
258 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  33.91 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  32.88 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  34.33 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.65 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  33.01 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  32.8 
 
 
257 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  33.76 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  34.42 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  33.92 
 
 
282 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  32.62 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  34.63 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  37.32 
 
 
259 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  36.45 
 
 
256 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  32.81 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  33.74 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  34.72 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  30.7 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  37.76 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
274 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  29.79 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  33.64 
 
 
252 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  33.03 
 
 
267 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  33.65 
 
 
256 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  34.93 
 
 
257 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 
259 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  34.93 
 
 
257 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  32.62 
 
 
260 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  33.03 
 
 
264 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  34.58 
 
 
277 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  34.06 
 
 
258 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
266 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  32.62 
 
 
259 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  32.68 
 
 
257 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  35.2 
 
 
259 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  32.35 
 
 
255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  32.35 
 
 
255 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  31.96 
 
 
237 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  32.2 
 
 
257 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  32.2 
 
 
257 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.2 
 
 
262 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  32.34 
 
 
257 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  32.5 
 
 
260 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  31.71 
 
 
257 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  34.12 
 
 
252 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  32.34 
 
 
257 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  31.84 
 
 
257 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  33.98 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  34.48 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  31.36 
 
 
255 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  30.8 
 
 
262 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  33.65 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  35.81 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  34.55 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  35.2 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  31.05 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  33.01 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  32.55 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  32.54 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  33.19 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>