More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2100 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  83.99 
 
 
458 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  70.64 
 
 
457 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  93.65 
 
 
458 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  100 
 
 
457 aa  932    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  76.14 
 
 
454 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  69.11 
 
 
457 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  69.18 
 
 
452 aa  631  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  66.97 
 
 
439 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  67.73 
 
 
445 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  67.81 
 
 
452 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  67.73 
 
 
445 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  67.12 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  65.23 
 
 
454 aa  595  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  64.52 
 
 
453 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  64.84 
 
 
441 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  65.44 
 
 
441 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  61.37 
 
 
460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  65.31 
 
 
434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  64.06 
 
 
442 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  63.93 
 
 
451 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  60.14 
 
 
456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  62.05 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  61.22 
 
 
450 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  63.23 
 
 
449 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  61.22 
 
 
457 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  60.77 
 
 
455 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  60.87 
 
 
448 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  56.4 
 
 
446 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  56.11 
 
 
441 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  59.68 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  58 
 
 
448 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.88 
 
 
440 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.61 
 
 
441 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  56.85 
 
 
445 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  56.64 
 
 
449 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.94 
 
 
441 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  58.18 
 
 
450 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.65 
 
 
448 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  54.92 
 
 
445 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  58.45 
 
 
450 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  54.55 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  55.13 
 
 
444 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  55.35 
 
 
444 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  56.52 
 
 
461 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  55.28 
 
 
448 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  53.72 
 
 
444 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  57.11 
 
 
450 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  54 
 
 
448 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  55.7 
 
 
442 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.78 
 
 
439 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.02 
 
 
448 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  54.02 
 
 
440 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  52.28 
 
 
443 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  55.38 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  53.33 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  53.91 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.53 
 
 
447 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.68 
 
 
445 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  52.33 
 
 
1121 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  52.7 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  51.82 
 
 
474 aa  448  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.49 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  51.43 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  52.47 
 
 
458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  55.28 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.56 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  51.69 
 
 
451 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  50.9 
 
 
441 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  52.27 
 
 
439 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  51.46 
 
 
472 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.87 
 
 
448 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  50.23 
 
 
453 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  48.77 
 
 
449 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  49.77 
 
 
443 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  48.65 
 
 
448 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  50.33 
 
 
455 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  49.56 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.33 
 
 
451 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  49.32 
 
 
451 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  49.66 
 
 
452 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  47.59 
 
 
454 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.53 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  47.02 
 
 
451 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  46.65 
 
 
492 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  46.59 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.35 
 
 
440 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  47.38 
 
 
438 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.6 
 
 
445 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  48.09 
 
 
438 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  46.67 
 
 
442 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  49.77 
 
 
454 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  46.73 
 
 
458 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  45.66 
 
 
442 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  46.17 
 
 
451 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  47.15 
 
 
467 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  46.73 
 
 
450 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  44.05 
 
 
449 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  44.05 
 
 
449 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  44.05 
 
 
449 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  44.05 
 
 
449 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>