More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2053 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  65.26 
 
 
518 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  100 
 
 
523 aa  1081    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  49.52 
 
 
536 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  47.38 
 
 
554 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  45.35 
 
 
549 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  45.04 
 
 
572 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  33.86 
 
 
512 aa  243  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  30.59 
 
 
514 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  30.22 
 
 
519 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  30.31 
 
 
508 aa  212  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  29.25 
 
 
507 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  29.16 
 
 
519 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  28.63 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  30.71 
 
 
494 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.18 
 
 
509 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  27.71 
 
 
482 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.57 
 
 
526 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.43 
 
 
505 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.72 
 
 
474 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  28.46 
 
 
501 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  28.31 
 
 
501 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  27.84 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  29.86 
 
 
594 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  27.65 
 
 
515 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  28.09 
 
 
511 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  26.87 
 
 
518 aa  144  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.21 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  27.46 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.37 
 
 
517 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  28.51 
 
 
476 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  27.78 
 
 
586 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.18 
 
 
516 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  30.41 
 
 
497 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.33 
 
 
516 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.33 
 
 
516 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.35 
 
 
535 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  27.96 
 
 
513 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.12 
 
 
516 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.21 
 
 
480 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.87 
 
 
503 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.24 
 
 
473 aa  136  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  26.89 
 
 
511 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  28.13 
 
 
517 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  28.13 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  27.51 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  28.13 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  28.13 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  28.13 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  28.13 
 
 
522 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  27.49 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  27.93 
 
 
517 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  29.26 
 
 
486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  28.6 
 
 
505 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  27.92 
 
 
499 aa  134  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.32 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  26.1 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  28.4 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  27.89 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.76 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  27.82 
 
 
502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  28.1 
 
 
505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  27.26 
 
 
504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  27.11 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  27.44 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  26.71 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.39 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  25.25 
 
 
503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.47 
 
 
520 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.57 
 
 
498 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  26.42 
 
 
502 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  27.36 
 
 
501 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  27.07 
 
 
502 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.15 
 
 
537 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  26.74 
 
 
504 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.52 
 
 
497 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  27.21 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.83 
 
 
486 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  25.25 
 
 
497 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  25.25 
 
 
497 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  25.25 
 
 
497 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  25.25 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  25.25 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  24.45 
 
 
565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.19 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  25.86 
 
 
495 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  25.35 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  25.88 
 
 
489 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2068  sulfatase  26.18 
 
 
491 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  25.14 
 
 
517 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  23.19 
 
 
501 aa  110  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  24.85 
 
 
497 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  24.58 
 
 
587 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  25.31 
 
 
594 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  26.46 
 
 
511 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  25.34 
 
 
493 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  23.43 
 
 
497 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  24.95 
 
 
478 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  27.38 
 
 
478 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  27.59 
 
 
482 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>