20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2038 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  100 
 
 
247 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  53.91 
 
 
230 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  54.74 
 
 
243 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  53.91 
 
 
230 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  53.48 
 
 
230 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  53.04 
 
 
230 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  51.74 
 
 
230 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  51.97 
 
 
249 aa  221  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  52.4 
 
 
229 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  52.4 
 
 
229 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  52.4 
 
 
229 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  50.87 
 
 
230 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  55.79 
 
 
229 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  50.6 
 
 
239 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  51.09 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  44.81 
 
 
244 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  35.38 
 
 
546 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  39.84 
 
 
525 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  33.93 
 
 
546 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  30.36 
 
 
611 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>