More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2028 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  86.18 
 
 		 217 aa  348  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  86.45 
 
 		 217 aa  345  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  74.52 
 
 		 208 aa  299  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  67.54 
 
 		 974 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  67.54 
 
 		 962 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  67.02 
 
 		 950 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  65.28 
 
 		 882 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  64.25 
 
 		 879 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  64.25 
 
 		 879 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  64.77 
 
 		 879 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  64.55 
 
 		 876 aa  228  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  56.57 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  63.41 
 
 		 1004 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  36.32 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  35.47 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.41 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.2 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.19 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35.27 
 
 		 743 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 		 293 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  33.88 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  38.46 
 
 		 292 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  31.03 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  32.76 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  38.46 
 
 		 292 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.56 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  36.81 
 
 		 292 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  32.06 
 
 		 832 aa  92  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  31.13 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  38.46 
 
 		 292 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  38.19 
 
 		 292 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  36.11 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  35.42 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  32.04 
 
 		 295 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 292 aa  89  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  37.5 
 
 		 439 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.84 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  33.14 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  38.73 
 
 		 291 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  31.84 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 295 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.96 
 
 		 295 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 		 241 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  34.54 
 
 		 825 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  32.85 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  40.14 
 
 		 293 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3381  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 275 aa  86.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  36.17 
 
 		 291 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  36.17 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  32.7 
 
 		 295 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  34.97 
 
 		 266 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  36.62 
 
 		 291 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 		 240 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  31.71 
 
 		 284 aa  85.5  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  32.11 
 
 		 239 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  38.73 
 
 		 291 aa  84.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  30.29 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  26.44 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.63 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  39.23 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  30.48 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  39.23 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  31.35 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  29.5 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  34.75 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  34.75 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  39.42 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  34.75 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  34.75 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  34.75 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  31.45 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  32.97 
 
 		 295 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  33.55 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  31.79 
 
 		 319 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  39.31 
 
 		 293 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  29.9 
 
 		 819 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  37.69 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.73 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  28.34 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  28.78 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  32.42 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  37.69 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  32.73 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  29.27 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>