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for query gene Bphyt_2022 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Plasmid clonability

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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.01 
 
 
519 aa  690  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.21 
 
 
517 aa  818  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.32 
 
 
519 aa  699  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.18 
 
 
517 aa  741  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5722  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.01 
 
 
519 aa  690  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102537  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.49 
 
 
520 aa  778  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.22288e-05  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.69 
 
 
517 aa  818  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78 
 
 
520 aa  797  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.76 
 
 
519 aa  636  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.92 
 
 
519 aa  696  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.76 
 
 
519 aa  637  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.76 
 
 
519 aa  636  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4583  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.01 
 
 
519 aa  690  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169299  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  77.73 
 
 
525 aa  787  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  73.29 
 
 
531 aa  731  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  78.54 
 
 
543 aa  792  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
520 aa  1020  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  83.37 
 
 
517 aa  854  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.31 
 
 
519 aa  681  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.42 
 
 
518 aa  823  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.66 
 
 
577 aa  776  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  79.84 
 
 
519 aa  799  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.76 
 
 
519 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.91 
 
 
519 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  60.12 
 
 
518 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.09 
 
 
518 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.35 
 
 
519 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.55 
 
 
519 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.05 
 
 
537 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.89 
 
 
518 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.95 
 
 
519 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  58.23 
 
 
520 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.46 
 
 
521 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.43 
 
 
520 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.28 
 
 
533 aa  603  1e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.69 
 
 
527 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.8 
 
 
544 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.62 
 
 
520 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.85 
 
 
524 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.02 
 
 
522 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  51.41 
 
 
512 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  51.41 
 
 
512 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  51.41 
 
 
512 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  51.21 
 
 
512 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.6 
 
 
515 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.64 
 
 
522 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.48 
 
 
522 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.8 
 
 
511 aa  506  1e-142  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  50.2 
 
 
511 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
511 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.44 
 
 
522 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  50.2 
 
 
511 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.1 
 
 
510 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.41 
 
 
513 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.59 
 
 
521 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.06 
 
 
515 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.2 
 
 
511 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.2 
 
 
511 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  51.41 
 
 
512 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  51.01 
 
 
512 aa  493  1e-138  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  50.81 
 
 
512 aa  492  1e-138  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.01 
 
 
520 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.01 
 
 
520 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.41 
 
 
520 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.41 
 
 
520 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.81 
 
 
520 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.81 
 
 
520 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.21 
 
 
520 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.19 
 
 
520 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.52739e-05  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  50.3 
 
 
515 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.3 
 
 
520 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.4 
 
 
511 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49 
 
 
511 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.6 
 
 
511 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.04 
 
 
520 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.6 
 
 
511 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  49.5 
 
 
512 aa  470  1e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.15 
 
 
520 aa  467  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.34 
 
 
520 aa  468  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.34 
 
 
520 aa  468  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  48.7 
 
 
509 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 
520 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 
520 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49 
 
 
512 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  48.7 
 
 
509 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  2.79343e-05  decreased coverage  0.00567017 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.21 
 
 
509 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
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NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.08 
 
 
529 aa  446  1e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
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