More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2013 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  73.52 
 
 		 870 aa  1110    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.76 
 
 		 846 aa  915    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  72.99 
 
 		 844 aa  1076    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  72.99 
 
 		 844 aa  1076    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  73.15 
 
 		 839 aa  1072    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  59.34 
 
 		 686 aa  788    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  72.99 
 
 		 844 aa  1076    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  68.35 
 
 		 698 aa  953    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  70.08 
 
 		 850 aa  1075    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  74.51 
 
 		 857 aa  1106    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  73.12 
 
 		 844 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  72.99 
 
 		 928 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 834 aa  1693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  64.63 
 
 		 841 aa  911    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  67.69 
 
 		 742 aa  961    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  73.94 
 
 		 862 aa  1123    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  62.16 
 
 		 846 aa  919    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  68.64 
 
 		 743 aa  975    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  74.49 
 
 		 787 aa  1046    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  61.29 
 
 		 846 aa  943    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  61.05 
 
 		 678 aa  768    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  63.88 
 
 		 810 aa  926    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  74.04 
 
 		 888 aa  1084    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  58.28 
 
 		 675 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  66.29 
 
 		 801 aa  943    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  92.61 
 
 		 838 aa  1548    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  74.51 
 
 		 858 aa  1117    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  73.15 
 
 		 839 aa  1071    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  68.06 
 
 		 743 aa  968    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  73.93 
 
 		 826 aa  1067    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  73.34 
 
 		 857 aa  1110    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  67.54 
 
 		 732 aa  946    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  68.06 
 
 		 743 aa  968    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  74.51 
 
 		 857 aa  1106    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  67.83 
 
 		 728 aa  938    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  68.79 
 
 		 787 aa  964    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  71.11 
 
 		 821 aa  1165    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  50 
 
 		 783 aa  629  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  41.42 
 
 		 750 aa  468  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  39.76 
 
 		 743 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  39.76 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.21 
 
 		 850 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  39.31 
 
 		 762 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.66 
 
 		 730 aa  438  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  40.13 
 
 		 755 aa  439  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  37.54 
 
 		 815 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.79 
 
 		 752 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.49 
 
 		 760 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.16 
 
 		 854 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.4 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.21 
 
 		 740 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.19 
 
 		 786 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.64 
 
 		 767 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 		 768 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.6 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.48 
 
 		 786 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.32 
 
 		 907 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.42 
 
 		 759 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.38 
 
 		 765 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.37 
 
 		 772 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.13 
 
 		 785 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  34.53 
 
 		 773 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.55 
 
 		 776 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.79 
 
 		 661 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.99 
 
 		 646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  33.92 
 
 		 819 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  31.32 
 
 		 771 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.5 
 
 		 791 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  31.7 
 
 		 797 aa  306  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  31.19 
 
 		 777 aa  304  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  32.92 
 
 		 683 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.63 
 
 		 795 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 		 790 aa  300  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.02 
 
 		 648 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.42 
 
 		 818 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 814 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  32.07 
 
 		 819 aa  292  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  32.2 
 
 		 819 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  32.07 
 
 		 819 aa  291  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 707 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  30 
 
 		 794 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  31.75 
 
 		 830 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 640 aa  288  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.1 
 
 		 748 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  29.86 
 
 		 794 aa  287  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 		 793 aa  287  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.03 
 
 		 712 aa  287  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.39 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.58 
 
 		 714 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 705 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  32.27 
 
 		 687 aa  284  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  30.65 
 
 		 833 aa  284  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  29.83 
 
 		 791 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 		 709 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>