More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2000 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  100 
 
 		 404 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  60.84 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3587  outer membrane porin OpcP  57.66 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4683  porin  58.75 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3591  porin  58.15 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4776  porin  58.15 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4159  porin  59.17 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  normal  0.746797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5507  porin  58.15 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0938  outer membrane protein (porin)  58.51 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1532  outer membrane porin OpcP  58.68 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.219612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3825  porin  57.66 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000419684 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1279  Outer membrane protein  59.21 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1360  putative outer membrane porin  59.21 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0948  putative outer membrane porin  59.21 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2471  outer membrane porin  59.21 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121676  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0343  putative outer membrane porin  59.21 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0623  putative outer membrane porin  59.21 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1206  outer membrane porin  59.21 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.1 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.9 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.41 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.94 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.65 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.65 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.65 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.65 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  39.9 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.35 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  38.35 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.56 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.44 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.4 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.4 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.4 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  39.28 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  39.19 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  40 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  38.38 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.66 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  39.13 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  38.85 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  37.62 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  38.68 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.2 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  38.66 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  38.66 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  38.61 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  38.61 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  38.61 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  37.88 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.92 
 
 		 399 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  37.8 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.88 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  37.1 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  38.13 
 
 		 408 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  37.29 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  38.93 
 
 		 414 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  37.96 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  39.13 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  38.42 
 
 		 384 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  36.66 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  35.75 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  35.79 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  37.38 
 
 		 387 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  36.12 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  38.71 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.54 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  38.71 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  36.12 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  37.47 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  36.41 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  36.96 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  38.46 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  38.46 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  38.46 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  38.46 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  37.78 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  38.46 
 
 		 430 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  36.71 
 
 		 380 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  37.2 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  36.75 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  36.12 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  37.82 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  36.12 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  37.2 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  35.8 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  37.24 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  37.24 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>