116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1949 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  94.36 
 
 		 195 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  84.1 
 
 		 195 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  75.38 
 
 		 195 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  73.33 
 
 		 195 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  72.31 
 
 		 195 aa  293  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  71.28 
 
 		 195 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  70.77 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  70.77 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  70.77 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  70.26 
 
 		 195 aa  287  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  69.74 
 
 		 195 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  67.36 
 
 		 194 aa  275  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  69.43 
 
 		 194 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  67.88 
 
 		 194 aa  274  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  67.88 
 
 		 194 aa  274  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  67.88 
 
 		 194 aa  274  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  70.26 
 
 		 195 aa  273  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  66.32 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  66.32 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 188 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  70 
 
 		 194 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  70.26 
 
 		 195 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  66.49 
 
 		 195 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  66.84 
 
 		 196 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  65.82 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  69.74 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  63.73 
 
 		 195 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  61.73 
 
 		 198 aa  244  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  62.18 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  55.38 
 
 		 192 aa  224  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  55.8 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  53.57 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  51.27 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  53.96 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  51.81 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  55 
 
 		 205 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  54.49 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  59.84 
 
 		 167 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  44.08 
 
 		 191 aa  137  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  44.94 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  42.77 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.82 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  42.53 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  39.07 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  44 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  44 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  44 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  41.33 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  35.2 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  29.32 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  32.05 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  35.21 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.85 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  35.82 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  35.82 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  33.08 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  33.08 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  34.62 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  28.07 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  33.33 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  31.85 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  35.82 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  32.09 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  28.92 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  31.79 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  32.31 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  28.72 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  32.84 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  32.56 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  27.66 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  33.56 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  30.25 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  30.61 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  28.89 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  39.74 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  28.16 
 
 		 260 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  31.68 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  30.23 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  31.65 
 
 		 267 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  33.96 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>