225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1886 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  767    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  89.63 
 
 
376 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  87.77 
 
 
376 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  81.4 
 
 
374 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  81.4 
 
 
374 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  81.13 
 
 
374 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  81.13 
 
 
374 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  78.42 
 
 
381 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  79.09 
 
 
374 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  79.57 
 
 
374 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  77.03 
 
 
374 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  64.69 
 
 
357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  64.62 
 
 
358 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  67.17 
 
 
363 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  64.35 
 
 
362 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  58.96 
 
 
366 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  60.36 
 
 
363 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  64.81 
 
 
363 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  62.39 
 
 
350 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  61 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  59.33 
 
 
366 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  51.88 
 
 
383 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  54.25 
 
 
355 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  52.28 
 
 
356 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  53.47 
 
 
358 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  52.28 
 
 
356 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.65 
 
 
372 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  46.91 
 
 
364 aa  348  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  49.38 
 
 
369 aa  348  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  49.57 
 
 
367 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  54.2 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.11 
 
 
318 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  51.88 
 
 
376 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  44.38 
 
 
364 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  45.43 
 
 
388 aa  269  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  45.35 
 
 
365 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.02 
 
 
385 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  42.07 
 
 
351 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  46.6 
 
 
371 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  43.57 
 
 
351 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  43.71 
 
 
372 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  37.24 
 
 
377 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  43.69 
 
 
367 aa  256  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.31 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  40.62 
 
 
320 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  42.01 
 
 
320 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  39.41 
 
 
320 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  39.41 
 
 
320 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  39.09 
 
 
320 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  43.65 
 
 
372 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  43.65 
 
 
372 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  43.65 
 
 
372 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  40.62 
 
 
320 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  39.35 
 
 
336 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  41.82 
 
 
360 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.27 
 
 
353 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  40.28 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  41.62 
 
 
409 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.29 
 
 
393 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  40.82 
 
 
403 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  41.14 
 
 
372 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  36.99 
 
 
361 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  36.79 
 
 
376 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.64 
 
 
419 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  44.49 
 
 
358 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  40.54 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  38.6 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  36.93 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  37.19 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  34.6 
 
 
353 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  39.3 
 
 
396 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  35.88 
 
 
361 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.02 
 
 
367 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  33.65 
 
 
354 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  36.36 
 
 
414 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  34.12 
 
 
333 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  36.99 
 
 
320 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  36.99 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.56 
 
 
378 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  37.07 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  36.1 
 
 
392 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.24 
 
 
380 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 
332 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  35 
 
 
361 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  35.62 
 
 
362 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  33.13 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.91 
 
 
354 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02069  hypothetical protein  36.99 
 
 
362 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  33.75 
 
 
342 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  33.75 
 
 
342 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  43.32 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  35.86 
 
 
324 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  35.86 
 
 
324 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  35.86 
 
 
324 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  35.86 
 
 
324 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  35.46 
 
 
324 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  35.46 
 
 
423 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  34.39 
 
 
324 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  36.22 
 
 
308 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>