More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1885 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  406  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  87.25 
 
 		 204 aa  359  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  91.28 
 
 		 195 aa  358  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 211 aa  317  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  76.96 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  76.96 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  76.96 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  75.98 
 
 		 217 aa  313  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 212 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  78.97 
 
 		 208 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 208 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  67.51 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 202 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  58.97 
 
 		 200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  55.78 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  36.27 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 222 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.5 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.17 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  33.17 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32.5 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.92 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.19 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
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NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
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NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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