More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1830 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 345 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  98.26 
 
 		 345 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  90.43 
 
 		 345 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  70.8 
 
 		 349 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  72.21 
 
 		 349 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  74.12 
 
 		 349 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  72.61 
 
 		 347 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  72.93 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  69.91 
 
 		 340 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  63.89 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  60.58 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  60 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  55.49 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  55.06 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.14 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  54.83 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  48.85 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  53.07 
 
 		 338 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  47.01 
 
 		 353 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  45.1 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.71 
 
 		 346 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  44.71 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  46.06 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  49.68 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  48.24 
 
 		 332 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  45.66 
 
 		 341 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  43.48 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  44.81 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.25 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  44.48 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  41.64 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  41.64 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.5 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.78 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  39.87 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  39.54 
 
 		 336 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  38.71 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  39.09 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  38.6 
 
 		 332 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  38.87 
 
 		 303 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  36.34 
 
 		 356 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  36.89 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  36.81 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.29 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.29 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  35.87 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  36.47 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.25 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.93 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.37 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.63 
 
 		 334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.63 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.63 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  28.12 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  27.7 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.24 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0266  NMT1/THI5 like domain protein  28.47 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  26.83 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  24.4 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.45 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  26.09 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  24 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.78 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  31.02 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  25.81 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.47 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.56 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  30.17 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  25.56 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.58 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  31.25 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  25.56 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.81 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.77 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  22.44 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.44 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.77 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.89 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.1 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  27.74 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4844  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  32.57 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  0.282799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>