92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1688 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  73.33 
 
 		 214 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  55.24 
 
 		 210 aa  247  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  40.95 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  40.76 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  35.38 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  37.98 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  35.78 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  35.89 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  35.85 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  35.07 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  38 
 
 		 200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  37.98 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  32.84 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  35.27 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  36.19 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  33.02 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  29.5 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  28.43 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  26.19 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  29.81 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.36 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  26.89 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  26.89 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  31.66 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.26 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.36 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  28.43 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  28.93 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  31.55 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.83 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  31.66 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.24 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  26.32 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  25.95 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  30.1 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  28.8 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  29.61 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  30.48 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  25.38 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  29.85 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  27.72 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  27.36 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.58 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  28.11 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  25.25 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  27.32 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  26.73 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  26.92 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  26.92 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  29.69 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25.25 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  25.82 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  25.82 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  25.93 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  25.27 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  25.81 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  25.67 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  31.2 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  25.76 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  26.72 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  21.6 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  22.12 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  22.12 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  25.59 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 219 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  23.42 
 
 		 208 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  27.64 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>