More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1653 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  100 
 
 
468 aa  927    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  94.05 
 
 
454 aa  795    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
441 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
432 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
441 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  71.81 
 
 
441 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
441 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
432 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
441 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  71.33 
 
 
432 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  69.16 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  69.16 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  69.64 
 
 
444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  69.16 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  66.67 
 
 
443 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  67.83 
 
 
443 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  66.67 
 
 
461 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  55.96 
 
 
454 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  55.96 
 
 
454 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  55.09 
 
 
454 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  53.02 
 
 
473 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  50.35 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  53.16 
 
 
469 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  49.18 
 
 
452 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  44.94 
 
 
492 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  44.99 
 
 
478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  44.99 
 
 
478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  40.65 
 
 
453 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  39.62 
 
 
461 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  40.72 
 
 
483 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  40.1 
 
 
419 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  41.87 
 
 
422 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  39.76 
 
 
416 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  38.85 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  37.86 
 
 
419 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  39.04 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  37.39 
 
 
408 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  40.32 
 
 
484 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  38.21 
 
 
493 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  35.45 
 
 
490 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  37.87 
 
 
482 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 
482 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  34.83 
 
 
477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  37.14 
 
 
496 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  35.24 
 
 
460 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  32.95 
 
 
526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  36.9 
 
 
460 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  37.2 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  37.2 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  37.2 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.52 
 
 
492 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  37.2 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  37.2 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  37.2 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.47 
 
 
460 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  42.91 
 
 
431 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  35.28 
 
 
455 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  32.53 
 
 
493 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  35 
 
 
473 aa  203  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  34 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
487 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.6 
 
 
478 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  32.72 
 
 
539 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  34.99 
 
 
530 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  31.62 
 
 
574 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  31.47 
 
 
483 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 
571 aa  187  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 
466 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 
517 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  34.21 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  36.1 
 
 
497 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 
491 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.55 
 
 
642 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.55 
 
 
642 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.29 
 
 
646 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  32.14 
 
 
486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  32.56 
 
 
620 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  30.42 
 
 
499 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  32.32 
 
 
463 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  31.62 
 
 
497 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  31.51 
 
 
479 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  30.3 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.55 
 
 
652 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  37.41 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  40.15 
 
 
657 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  34.86 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  35.14 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  32.86 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  34.69 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.55 
 
 
491 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  39.77 
 
 
656 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 
474 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  33.91 
 
 
633 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 
443 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  41.35 
 
 
679 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  34.19 
 
 
479 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 
501 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  31.31 
 
 
700 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  40.98 
 
 
690 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>