More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1618 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 446 aa  908    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  95.37 
 
 		 440 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  75.3 
 
 		 424 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  54.46 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  55.01 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  55.01 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  55.01 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  56.48 
 
 		 426 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  55.83 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  55.91 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  50.12 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  50 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  52.04 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  51.65 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  55.13 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  55.13 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  55.13 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  36.69 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  39.13 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  38.97 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  38.97 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  38.97 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  32.29 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  38.36 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  38.36 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  38.62 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  39.59 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  37.76 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  38.82 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  34.45 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  38.56 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  38.56 
 
 		 464 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  38.82 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  36.71 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 		 424 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  32.55 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  36.48 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  35.52 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  35.92 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  35.98 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  35.98 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  35.75 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.98 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  36 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  35.73 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.73 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.73 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  34.67 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  35.25 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.46 
 
 		 780 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.2 
 
 		 777 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.29 
 
 		 790 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  30.31 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  25.38 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  28.21 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.73 
 
 		 596 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  34.78 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  28.5 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  36.1 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  33.86 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  33.19 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.28 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  33.99 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  29.75 
 
 		 266 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  37.28 
 
 		 601 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  37.28 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  30.71 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  36.12 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  30.43 
 
 		 272 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.51 
 
 		 592 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  32.49 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  35.4 
 
 		 590 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.42 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  30.77 
 
 		 272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.04 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.12 
 
 		 590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  30.87 
 
 		 584 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.92 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.79 
 
 		 599 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 584 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  29.91 
 
 		 584 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.09 
 
 		 585 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.93 
 
 		 594 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.93 
 
 		 594 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  27.13 
 
 		 263 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.09 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.09 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 584 aa  106  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 583 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 		 583 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.09 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>