More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1479 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  100 
 
 
341 aa  683  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  70.09 
 
 
340 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  50.58 
 
 
357 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  50.58 
 
 
357 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  50.44 
 
 
357 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  50.16 
 
 
357 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  50.16 
 
 
357 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  38.48 
 
 
357 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  38.18 
 
 
357 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  38.76 
 
 
358 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  38.69 
 
 
358 aa  189  6e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  38.48 
 
 
358 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  37.29 
 
 
358 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  36.47 
 
 
367 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  37.01 
 
 
358 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  38.55 
 
 
358 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  37.85 
 
 
358 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  37.85 
 
 
358 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  38.55 
 
 
387 aa  185  1e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  37.85 
 
 
358 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  37.5 
 
 
351 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  36.86 
 
 
356 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  38.25 
 
 
358 aa  183  4e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  37.13 
 
 
352 aa  182  5e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  37.13 
 
 
352 aa  182  5e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  36.56 
 
 
356 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  35.89 
 
 
360 aa  180  3e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  35.57 
 
 
344 aa  175  1e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  36.34 
 
 
344 aa  175  1e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  33.61 
 
 
363 aa  174  2e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  36.63 
 
 
362 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  34.41 
 
 
344 aa  167  3e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  34.18 
 
 
365 aa  167  3e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  34.06 
 
 
342 aa  164  2e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  34.83 
 
 
361 aa  164  2e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  34.83 
 
 
361 aa  163  5e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  32.69 
 
 
359 aa  162  8e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  33.7 
 
 
361 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  33.23 
 
 
341 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  37.58 
 
 
332 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  33.02 
 
 
340 aa  154  3e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.35 
 
 
357 aa  116  4e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  33.23 
 
 
351 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  29.66 
 
 
395 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  30.73 
 
 
400 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  30.47 
 
 
400 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  29.95 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.01 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.05 
 
 
389 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  32.65 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  29.31 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  30.77 
 
 
385 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  30.66 
 
 
436 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  29.26 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  30.39 
 
 
436 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  30.49 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  30.39 
 
 
386 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.02 
 
 
369 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  3.49197e-07  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  30.39 
 
 
386 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  30.39 
 
 
386 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  30.39 
 
 
386 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  30.39 
 
 
386 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  31.74 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  30 
 
 
348 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  29.25 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  28.87 
 
 
389 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.53 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  4.23032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  28.01 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  30.85 
 
 
471 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  30.11 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  29.23 
 
 
391 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  27.54 
 
 
354 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  29.72 
 
 
409 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  27.54 
 
 
354 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  28.37 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  27.54 
 
 
357 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  28.35 
 
 
374 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  28.73 
 
 
389 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  28.32 
 
 
409 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  28.32 
 
 
409 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  28.72 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.51 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  27.76 
 
 
383 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  30.99 
 
 
403 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  27.97 
 
 
386 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  28.94 
 
 
388 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  29.81 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  29.81 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  28.32 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  27.97 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  27.97 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  29.67 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  28.1 
 
 
386 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  26.8 
 
 
370 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  30.35 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  27.41 
 
 
386 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  29.64 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  28.93 
 
 
383 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0189  porin Gram-negative type  28.9 
 
 
362 aa  85.1  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615373  hitchhiker  0.00390966 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  29.75 
 
 
383 aa  85.9  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>