More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1280 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 269 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  96.28 
 
 		 306 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  71.27 
 
 		 305 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  44.58 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  46.78 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  45.02 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  44.59 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  45.02 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  45.02 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  44.59 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  42.62 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  43.33 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  37.7 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  36.59 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  34.16 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.16 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  39.81 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 298 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  40 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.26 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  41.38 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  35.92 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 274 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  34.25 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1010  MscS Mechanosensitive ion channel  41.08 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.6 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  31.6 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  39.47 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  34.98 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  38.95 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  38.95 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.71 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  32.38 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  34.07 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.46 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  34.07 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  34.07 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  34.07 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.46 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  34.07 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 		 327 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  34.21 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  34.21 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  40 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  29.51 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>