96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1261 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  64.47 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  57.46 
 
 		 187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  66.89 
 
 		 180 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  52.25 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  55.62 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  60.58 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  56.95 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  56.29 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  56.29 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  54.68 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  55.4 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  52.52 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  53.24 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  51.95 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  51.95 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  51.95 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  51.3 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  51.3 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  51.3 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  51.3 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  53.33 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  39.64 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  41.06 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  41.06 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  43.05 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  43.07 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  36.09 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  42.34 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  42.34 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  34.11 
 
 		 142 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  39.36 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.82 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  35.54 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  31.54 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  34.31 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  30.33 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  29.6 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  32.99 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  32.48 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  42.5 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  32.2 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  31.71 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  31.06 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  31.48 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  38.75 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  27.03 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  29.7 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  30.63 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  30.48 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  27.61 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  28 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  37.18 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  27.56 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  25.83 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  33.75 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  28.08 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  26.5 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  23.48 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  28.09 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  37.5 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  32.26 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  28.23 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  36.07 
 
 		 85 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  31.96 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  30.87 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  28.92 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  31.43 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  29.6 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  30.85 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  22.92 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.97 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 402 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  26.52 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  30.53 
 
 		 128 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  29.11 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  37.08 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  30.53 
 
 		 128 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  24.1 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  37.08 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  24.1 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  24.11 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  35.96 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2585  protein of unknown function DUF1486  37.33 
 
 		 143 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118925  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  24.62 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  32.91 
 
 		 132 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  30.11 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>