203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1227 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  100 
 
 
137 aa  289  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  88.32 
 
 
138 aa  256  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.24 
 
 
144 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  54.41 
 
 
155 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  54.07 
 
 
137 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  52.86 
 
 
143 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  55.56 
 
 
135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0315736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  51.85 
 
 
139 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  52.14 
 
 
143 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  52.14 
 
 
143 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4467  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50.38 
 
 
144 aa  140  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358832  normal  0.022389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.18 
 
 
149 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  50 
 
 
151 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
151 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4614  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  46.9 
 
 
144 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  47.06 
 
 
279 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
151 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
151 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3064  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.45 
 
 
138 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.94 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1324  glyoxalase family protein  48.92 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0961  glyoxalase family protein  50.36 
 
 
144 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.45 
 
 
142 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.45 
 
 
142 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1941  glyoxalase family protein  48.92 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.758162  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1012  glyoxalase family protein  48.92 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0853  glyoxalase family protein  48.92 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1173  VOC metalloenzyme family protein  48.92 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.71319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0295  glyoxalase family protein  48.92 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1165  VOC metalloenzyme family protein  48.92 
 
 
144 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.13 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  49.25 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6895  glyoxalase family protein  48.15 
 
 
137 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.008726  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  48.51 
 
 
137 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5925  hypothetical protein  43.94 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146885  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.11 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.48 
 
 
136 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458009  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  41.35 
 
 
284 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4634  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.872407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4543  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  42.54 
 
 
137 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4634  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4683  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  42.54 
 
 
137 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4550  hypothetical protein  37.86 
 
 
147 aa  103  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1375  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.59 
 
 
133 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0310  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0504777 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5280  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.41 
 
 
148 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
133 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03978  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.43 
 
 
147 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3920  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5620  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03939  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4608  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4347  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4661  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4572  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4028  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.04 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0559791  normal  0.357373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.93 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.1 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2265  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.3 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289163  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.62 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0411  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.04 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195958  normal  0.144933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  31.62 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  31.62 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.8 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309369  normal  0.188926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3682  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.56 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.867816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3665  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.21 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3122  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.07 
 
 
139 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364708  normal  0.0270793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4168  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.56 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0156126  hitchhiker  0.00300436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4475  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
137 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.81 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.73608  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1958  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1934  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.66 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.358523  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.88 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0029  PhnB protein  36.15 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403111  normal  0.0726467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000314859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5411  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2509  hypothetical protein  31.01 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1560  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3596  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.85 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000394768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2362  hypothetical protein  31.01 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0327  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.81 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.247487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2043  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.16 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5402  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>