175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0946 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  72.93 
 
 
629 aa  947    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  55.25 
 
 
626 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  75.36 
 
 
629 aa  967    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  64.97 
 
 
626 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  60.99 
 
 
627 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  62.74 
 
 
626 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  75.2 
 
 
629 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  70.91 
 
 
629 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  55.25 
 
 
626 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  72.77 
 
 
629 aa  955    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  61.18 
 
 
639 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  60.57 
 
 
654 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  62.58 
 
 
626 aa  816    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  62.42 
 
 
626 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  77.78 
 
 
630 aa  1004    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  67.57 
 
 
629 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  55.71 
 
 
628 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  55.25 
 
 
626 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  74.68 
 
 
629 aa  969    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  60.99 
 
 
627 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  75.36 
 
 
629 aa  967    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  61.31 
 
 
627 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  75.36 
 
 
629 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  52.7 
 
 
637 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  62.74 
 
 
626 aa  819    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  75.36 
 
 
629 aa  969    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 
629 aa  1284    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  52.61 
 
 
633 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  62.74 
 
 
626 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  75.2 
 
 
629 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  62.74 
 
 
626 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  75.36 
 
 
629 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  51.74 
 
 
642 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  47.44 
 
 
623 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  47.7 
 
 
623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  47.86 
 
 
623 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  47.7 
 
 
623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  47.7 
 
 
623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  47.7 
 
 
623 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  47.7 
 
 
623 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  47.7 
 
 
623 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  47.39 
 
 
623 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.1 
 
 
623 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  46.74 
 
 
620 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  44.55 
 
 
628 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  43.49 
 
 
624 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.18 
 
 
624 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  43.17 
 
 
619 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  43.02 
 
 
619 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  43.89 
 
 
641 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  41.95 
 
 
624 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  42.63 
 
 
619 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  41.73 
 
 
630 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  42.34 
 
 
638 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  39.49 
 
 
625 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.62 
 
 
652 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.05 
 
 
647 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  32.28 
 
 
605 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.86 
 
 
610 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  31.65 
 
 
611 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.18 
 
 
590 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.65 
 
 
590 aa  270  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  31.24 
 
 
606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  31.14 
 
 
589 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.77 
 
 
606 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  30.78 
 
 
606 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  30.94 
 
 
606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  31.01 
 
 
611 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  31.01 
 
 
611 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  31.01 
 
 
611 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  31.01 
 
 
611 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  31.01 
 
 
611 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  30.85 
 
 
611 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  33.18 
 
 
621 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.85 
 
 
611 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  31.1 
 
 
597 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.55 
 
 
612 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  32.93 
 
 
621 aa  252  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  30.94 
 
 
597 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  31.13 
 
 
589 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  31.02 
 
 
597 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  31.5 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  31.21 
 
 
620 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  31.14 
 
 
616 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  31.49 
 
 
612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.23 
 
 
612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  31.49 
 
 
612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  31.33 
 
 
612 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  31.33 
 
 
612 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.16 
 
 
588 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  29.73 
 
 
588 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  29.42 
 
 
588 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.42 
 
 
593 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  32.06 
 
 
611 aa  236  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  29.42 
 
 
588 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.63 
 
 
609 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  28.25 
 
 
614 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  28.25 
 
 
614 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  28.25 
 
 
614 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.01 
 
 
607 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>