More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0703 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  80 
 
 
425 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  79.53 
 
 
425 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  79.29 
 
 
425 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  82.35 
 
 
425 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  79.53 
 
 
425 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
425 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  79.22 
 
 
427 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  96.71 
 
 
425 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  80 
 
 
425 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  79.29 
 
 
425 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  80 
 
 
425 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  76.58 
 
 
499 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  59.31 
 
 
427 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  58.59 
 
 
428 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  56.07 
 
 
428 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  55.37 
 
 
428 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  55.37 
 
 
428 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  54.46 
 
 
440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  54.91 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  57.48 
 
 
428 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  56.04 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  55.74 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  57.48 
 
 
428 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 
457 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 
443 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  52.87 
 
 
452 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.3 
 
 
454 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  52.87 
 
 
435 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  52.87 
 
 
425 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  53.14 
 
 
443 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1004  major facilitator family transporter  52.12 
 
 
413 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0563  putative integral membrane transport protein  52.12 
 
 
413 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  53.46 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  50.59 
 
 
431 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  51.77 
 
 
425 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  51.31 
 
 
424 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  51.31 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  49.76 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 
444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.46 
 
 
430 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.46 
 
 
435 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  49.04 
 
 
438 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  49.04 
 
 
438 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  50.37 
 
 
438 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  48.8 
 
 
438 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  49.88 
 
 
436 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  47.85 
 
 
438 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  49.52 
 
 
440 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  49.29 
 
 
435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  48.92 
 
 
435 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  50.49 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  49.29 
 
 
435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  49.29 
 
 
435 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  49.75 
 
 
435 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  49.75 
 
 
435 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 
438 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  49.75 
 
 
435 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  49.04 
 
 
438 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  49.62 
 
 
431 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  49 
 
 
417 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  47.73 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  45.54 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  45.66 
 
 
436 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  48.52 
 
 
439 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  45.41 
 
 
436 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  47.55 
 
 
439 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  44.91 
 
 
436 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  46.34 
 
 
433 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  45.8 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  46.92 
 
 
441 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  46.25 
 
 
440 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  44.29 
 
 
449 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  45.67 
 
 
447 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  46.78 
 
 
445 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.71 
 
 
442 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  47.1 
 
 
445 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  46.78 
 
 
445 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  46.78 
 
 
445 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  46.78 
 
 
445 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  46.68 
 
 
433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  46.19 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  43.18 
 
 
428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.29 
 
 
452 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  47.04 
 
 
420 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  45.84 
 
 
444 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  42.39 
 
 
448 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 
452 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  45.21 
 
 
443 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  44.2 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.74 
 
 
443 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  43.84 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.76 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  44.33 
 
 
443 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>