More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0646 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  54.23 
 
 
1277 aa  1414    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 
1221 aa  766    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  88.42 
 
 
1344 aa  2467    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  67.15 
 
 
1308 aa  1819    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  80.03 
 
 
1345 aa  2218    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  34.98 
 
 
1212 aa  731    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  57.06 
 
 
1280 aa  1555    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  66.98 
 
 
1307 aa  1845    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
1364 aa  2828    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.89 
 
 
1304 aa  1895    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  70.05 
 
 
1308 aa  1904    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  69.38 
 
 
1292 aa  1918    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  88.27 
 
 
1342 aa  2479    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  70.82 
 
 
1279 aa  1966    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  66.1 
 
 
1291 aa  1792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  81.25 
 
 
1324 aa  2278    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  64.34 
 
 
1259 aa  1703    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.42 
 
 
1286 aa  1447    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  34.98 
 
 
1212 aa  733    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  54.23 
 
 
1277 aa  1414    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  88.34 
 
 
1342 aa  2484    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.25 
 
 
1309 aa  1941    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  79.52 
 
 
1345 aa  2217    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  87.32 
 
 
1341 aa  2457    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  34.75 
 
 
1217 aa  727    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  35.72 
 
 
1214 aa  744    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  36.1 
 
 
1218 aa  756    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  88.27 
 
 
1342 aa  2479    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 
1218 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  65.32 
 
 
1292 aa  1733    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.11 
 
 
1282 aa  1355    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.83 
 
 
1341 aa  2455    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  88.05 
 
 
1359 aa  2457    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.05 
 
 
1307 aa  1846    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  35.74 
 
 
1213 aa  745    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.44 
 
 
1265 aa  1878    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  36.45 
 
 
1210 aa  758    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  88.27 
 
 
1342 aa  2479    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  67.41 
 
 
1307 aa  1876    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  79.67 
 
 
1345 aa  2219    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  63.75 
 
 
1271 aa  1740    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  69.51 
 
 
1300 aa  1929    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  98 
 
 
1349 aa  2706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  88.2 
 
 
1342 aa  2479    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.28 
 
 
1289 aa  1521    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  80.88 
 
 
1324 aa  2268    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.99 
 
 
1292 aa  1802    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.54 
 
 
1304 aa  1881    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  88.34 
 
 
1342 aa  2484    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  88.12 
 
 
1340 aa  2459    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  87.83 
 
 
1341 aa  2455    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  36.39 
 
 
1202 aa  783    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  88.27 
 
 
1342 aa  2479    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.42 
 
 
1288 aa  1516    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.83 
 
 
1341 aa  2455    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.9 
 
 
1371 aa  2529    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  88.05 
 
 
1340 aa  2458    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.75 
 
 
1279 aa  1970    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
1183 aa  526  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 
1197 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.98 
 
 
1227 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 
1183 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.63 
 
 
1187 aa  260  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  37 
 
 
1188 aa  259  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 
1204 aa  254  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  25.51 
 
 
457 aa  107  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.06 
 
 
459 aa  106  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  25.69 
 
 
472 aa  106  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.55 
 
 
430 aa  106  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  25.44 
 
 
472 aa  105  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.81 
 
 
459 aa  104  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  23.84 
 
 
456 aa  100  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  24.94 
 
 
473 aa  99.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.73 
 
 
411 aa  99.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.04 
 
 
469 aa  99.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.18 
 
 
473 aa  98.2  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  25.18 
 
 
473 aa  98.2  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.32 
 
 
493 aa  97.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.43 
 
 
472 aa  97.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  25.13 
 
 
473 aa  96.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.76 
 
 
418 aa  96.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.39 
 
 
460 aa  95.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.46 
 
 
461 aa  95.5  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.8 
 
 
460 aa  95.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.8 
 
 
460 aa  95.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.46 
 
 
473 aa  95.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.69 
 
 
475 aa  95.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.22 
 
 
473 aa  95.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.92 
 
 
460 aa  95.1  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.22 
 
 
473 aa  94.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  24.15 
 
 
461 aa  94  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.42 
 
 
434 aa  93.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.51 
 
 
485 aa  92  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.48 
 
 
475 aa  91.7  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  24.87 
 
 
524 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  30.3 
 
 
477 aa  90.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.54 
 
 
479 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  23.08 
 
 
730 aa  90.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  24.87 
 
 
473 aa  90.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.91 
 
 
479 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>