More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0626 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  92.86 
 
 		 257 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  76.25 
 
 		 240 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  65.05 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  65.05 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  65.05 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  64.08 
 
 		 236 aa  274  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  63.59 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  63.59 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  63.11 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  56.52 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  56.09 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  63.05 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  63.05 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  63.05 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  63.05 
 
 		 249 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  63.05 
 
 		 249 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  63.05 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  63.05 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  52.72 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  63.05 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  57.14 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  59.71 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  56.28 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  56.28 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  56.28 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  61 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  56.31 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  48.31 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  54.55 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  51.26 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  50.75 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  50.72 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  46.95 
 
 		 284 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  50.75 
 
 		 283 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  49.76 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  48.76 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  48 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  47.8 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  45.7 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  37.11 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  33.82 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.78 
 
 		 318 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  34.95 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  37.33 
 
 		 217 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  42.01 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  35.29 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.86 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  36.41 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  38.29 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  35.09 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  32.54 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.67 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.3 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  36.65 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.51 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.39 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  36.11 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  38.24 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  38.24 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  36.26 
 
 		 217 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  36.16 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.87 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  33.18 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  32.23 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  35.71 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  33.33 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  32.24 
 
 		 210 aa  98.6  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  33.81 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.18 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  32.85 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  35 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.77 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  32.2 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  32.75 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  32.75 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.98 
 
 		 200 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  33.93 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.53 
 
 		 206 aa  95.5  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  41.42 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.64 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  32.39 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  31.87 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>