More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0613 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  72.47 
 
 		 459 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  95.94 
 
 		 468 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 473 aa  937    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  63.84 
 
 		 462 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  63.39 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  55.53 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  49.78 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  49.33 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.76 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  49.66 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.17 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  45.89 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.83 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  44.65 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  40.45 
 
 		 452 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  38.14 
 
 		 452 aa  299  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  38.14 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  38.14 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  38.69 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  37.92 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 452 aa  296  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  37.2 
 
 		 416 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  36.36 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.08 
 
 		 459 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  34.45 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  34.23 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  34.23 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  34 
 
 		 459 aa  240  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  33.33 
 
 		 459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.11 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 477 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.56 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  31.26 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 488 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 492 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.18 
 
 		 487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 494 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.9 
 
 		 472 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 475 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  31.3 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  31.81 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 487 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.54 
 
 		 468 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  32.18 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.13 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 474 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.31 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.62 
 
 		 455 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.03 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.33 
 
 		 459 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 474 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.65 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.46 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.46 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.46 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.46 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.46 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.46 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>