53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0527 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  86.71 
 
 		 429 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  85.78 
 
 		 429 aa  765    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  85.78 
 
 		 429 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  86.01 
 
 		 429 aa  768    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  86.71 
 
 		 429 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  86.25 
 
 		 429 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  86.71 
 
 		 429 aa  781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  76.98 
 
 		 431 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  99.53 
 
 		 429 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  86.01 
 
 		 429 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  85.78 
 
 		 429 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  71.5 
 
 		 432 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  86.48 
 
 		 429 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  86.25 
 
 		 429 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  70.63 
 
 		 432 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  86.25 
 
 		 429 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  86.25 
 
 		 429 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  86.01 
 
 		 429 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  94.64 
 
 		 429 aa  847    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 		 429 aa  885    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  76.51 
 
 		 431 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  75.12 
 
 		 431 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  75.12 
 
 		 431 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  85.78 
 
 		 429 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  74.65 
 
 		 431 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  67.92 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  67.92 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  68.15 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  66.28 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  67.37 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  65.34 
 
 		 431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  64.87 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  64.64 
 
 		 431 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  63.08 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  63.76 
 
 		 437 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  62.5 
 
 		 436 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  60.75 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  60.19 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  60.43 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  61.23 
 
 		 431 aa  544  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  59.25 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  51.11 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  51.55 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  51.55 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  49.02 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  50.99 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  50.99 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  48.78 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  48.3 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  33.25 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  36.97 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  32.84 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  34.23 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>