More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0445 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  90.28 
 
 
245 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  73.93 
 
 
239 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0171  dithiobiotin synthetase  76.07 
 
 
239 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  71.37 
 
 
239 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2845  dithiobiotin synthetase  71.37 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2319  dithiobiotin synthetase  71.43 
 
 
239 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0506133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2933  dithiobiotin synthetase  71.43 
 
 
239 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2948  dithiobiotin synthetase  71.86 
 
 
239 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2982  dithiobiotin synthetase  71.79 
 
 
239 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0338  dithiobiotin synthetase  68.53 
 
 
240 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2016  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0102  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.545231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3078  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2270  dithiobiotin synthetase  69.06 
 
 
240 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  51.58 
 
 
266 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  50.65 
 
 
254 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  52.58 
 
 
221 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  55.51 
 
 
235 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  53.62 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  50.48 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  50.97 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  51.14 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  52.56 
 
 
240 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  55.8 
 
 
235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  48.36 
 
 
236 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  50 
 
 
230 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1479  dithiobiotin synthetase  55.07 
 
 
229 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324532  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  46.41 
 
 
238 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  44.83 
 
 
231 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  44.4 
 
 
231 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  50 
 
 
226 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  43.97 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  43.97 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  46.54 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  43.81 
 
 
226 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  42.48 
 
 
226 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  42.92 
 
 
226 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  46.4 
 
 
243 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  45.13 
 
 
226 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  44.69 
 
 
226 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  41.67 
 
 
228 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  45.58 
 
 
226 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  45.58 
 
 
228 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  42.48 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  40.53 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  40.53 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  44.39 
 
 
231 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  46.82 
 
 
237 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  46.26 
 
 
237 aa  161  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  40.38 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  44.16 
 
 
221 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  41.96 
 
 
226 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  41.18 
 
 
237 aa  158  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 
227 aa  158  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  46.05 
 
 
233 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  44.59 
 
 
225 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  42.28 
 
 
246 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  39.65 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3842  dethiobiotin synthase  51.7 
 
 
194 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  45.97 
 
 
227 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  41.7 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  44.59 
 
 
225 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  40.34 
 
 
236 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  44.59 
 
 
225 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  44.59 
 
 
225 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  41.8 
 
 
246 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  42.51 
 
 
226 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  44.59 
 
 
225 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  44.59 
 
 
225 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  44.59 
 
 
225 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  39.37 
 
 
235 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  44.14 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  43.69 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  44.14 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  41.52 
 
 
230 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 
227 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  41.07 
 
 
228 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  41.07 
 
 
230 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  45.24 
 
 
237 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  41.07 
 
 
228 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  41.39 
 
 
246 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  41.07 
 
 
228 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 
240 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  40.28 
 
 
245 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  46.92 
 
 
226 aa  148  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  44.5 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  47.14 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  44.98 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 
240 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  39.42 
 
 
226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 
222 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 
222 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  41.56 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  39.41 
 
 
234 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>