More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0429 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  96.12 
 
 		 361 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  100 
 
 		 361 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  73.58 
 
 		 367 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  71.82 
 
 		 358 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  72.38 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  71.82 
 
 		 358 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  71.55 
 
 		 358 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  70.72 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  71.55 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  71.55 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  70.44 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  71.55 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  70.44 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  70.72 
 
 		 358 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  54.99 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  53.04 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  55.89 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  53.41 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  53.41 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  55.29 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  54.79 
 
 		 351 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  54.35 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  54.35 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  51.37 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  49.86 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  42.58 
 
 		 365 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  42.61 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  41.48 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  42.98 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  45.96 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.17 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.14 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  36.99 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  36.99 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  38.28 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  37.46 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  36.11 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  36.11 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  38.02 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  35.41 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  34.51 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  35.57 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  32.77 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  35.28 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.9 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  34.99 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  34.99 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  34.69 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  34.49 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  34.49 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  30.93 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  32.14 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.14 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  33.43 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.7 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  32.14 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  34.67 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  33.69 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.98 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.63 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.09 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  34.1 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  32.79 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  33.43 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  32.79 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  32.79 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.8 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  35.38 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  29.97 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  31.27 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.76 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  31.1 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  33.06 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  30.5 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.79 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  31.44 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  31.64 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.03 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  31.25 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.75 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  32.3 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  31.99 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.25 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  32.58 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.4 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.4 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  32.01 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.24 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.4 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.75 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.4 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.24 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31.4 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  31.74 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31.4 
 
 		 436 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  31.36 
 
 		 400 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  31.97 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  28.64 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>