More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0271 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 358 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  40.28 
 
 		 433 aa  276  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  38.57 
 
 		 431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  35.75 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  35.23 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  39.38 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  37.32 
 
 		 430 aa  226  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  33.8 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  38.22 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  35.25 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  36.75 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  36.86 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  32.87 
 
 		 445 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  35.4 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  34.76 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  30.09 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  33.91 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  34.22 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  33.94 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  34.29 
 
 		 412 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  34.66 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  33.64 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  34.45 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  33.92 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  32.76 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  33.24 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  31.91 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  34.35 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  33.64 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  34.25 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  34.15 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  33.05 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  33.63 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  33.94 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  33.94 
 
 		 438 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  33.94 
 
 		 424 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  33.94 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  31.53 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  34.53 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  32.63 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  33.94 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  33.64 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  33.64 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  33.05 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  33.64 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  32.11 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  32.31 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 427 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  34.56 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  32.77 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  32.83 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  32.21 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  33.84 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  33.54 
 
 		 433 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  33.12 
 
 		 427 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  30.36 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  33.84 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  33.03 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  33.63 
 
 		 434 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  32.54 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  32.54 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  32.54 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  33.23 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  32.29 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  32.63 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  32.25 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  32.63 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  32.25 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  32.25 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  33.12 
 
 		 427 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  32.63 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  32.25 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  32.72 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  31.93 
 
 		 423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  31.28 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  31.8 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  33.54 
 
 		 434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  34.86 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  33.63 
 
 		 433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  34.24 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  31.75 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  33.93 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  32.72 
 
 		 430 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  31.04 
 
 		 412 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  31.82 
 
 		 433 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  30.9 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  30.97 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  33.23 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  33.23 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  31.34 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  32.83 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  33.91 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>