More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0194 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  76.78 
 
 		 280 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 292 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.08 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  31.1 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.86 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  30.47 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  29.92 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.79 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.17 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.7 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  28.97 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  28.97 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.71 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.71 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.71 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.25 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.49 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  29.46 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  32.66 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.04 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  32.66 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.24 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 259 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 260 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.88 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.8 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.88 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.88 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.88 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.88 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  27.38 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>