146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0193 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  77.89 
 
 
289 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  75 
 
 
286 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  42.09 
 
 
306 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  39.86 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
310 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
310 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  38.04 
 
 
283 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
310 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  40.3 
 
 
286 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  40.94 
 
 
309 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  40.94 
 
 
312 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  39.41 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  39.47 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  41.48 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  39.41 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  39.03 
 
 
289 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  39.93 
 
 
321 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  40.58 
 
 
312 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  39.55 
 
 
291 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.82 
 
 
300 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
287 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  38.73 
 
 
295 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  39.43 
 
 
302 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
290 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.58 
 
 
320 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  38.93 
 
 
297 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.56 
 
 
296 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  39.31 
 
 
311 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.31 
 
 
289 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  38.26 
 
 
272 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  36.61 
 
 
304 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.94 
 
 
300 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  38.85 
 
 
296 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.3 
 
 
290 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
296 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
325 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
274 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  36.86 
 
 
273 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  33.92 
 
 
307 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  35.61 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
293 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  33 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  39.19 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
327 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  37.72 
 
 
308 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
293 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  39.62 
 
 
293 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
312 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  34.97 
 
 
305 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  32.64 
 
 
314 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  39.21 
 
 
320 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
305 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  38.69 
 
 
274 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
302 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  36.2 
 
 
285 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  31.02 
 
 
304 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.25 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  31.69 
 
 
313 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
287 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
312 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  32.04 
 
 
304 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  32.04 
 
 
302 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  31.64 
 
 
295 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
295 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
290 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  38.01 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  34.32 
 
 
296 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  40.62 
 
 
198 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  40.62 
 
 
198 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
295 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  31.34 
 
 
318 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  32.96 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.71 
 
 
306 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.71 
 
 
306 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
287 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
280 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
303 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  31.2 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  31.23 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 
318 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  32.47 
 
 
277 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  31.5 
 
 
308 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  29.39 
 
 
302 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
284 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  30.56 
 
 
252 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  31.14 
 
 
368 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  29.52 
 
 
291 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  30.56 
 
 
252 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  31.14 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>