More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0189 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0189  porin Gram-negative type  100 
 
 		 362 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615373  hitchhiker  0.00390966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  77.16 
 
 		 369 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0973  OmpC family outer membrane porin  78.2 
 
 		 393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000310087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  58.45 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  41.76 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  39.26 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  40.56 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  40.56 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  34.7 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  35.52 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  36.22 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  33.25 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.97 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  36.17 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  35.61 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  35.85 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  35.85 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  35.85 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  35.85 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  34.02 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.5 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  35.37 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.58 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  35.37 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  35.59 
 
 		 394 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  35.58 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  35.59 
 
 		 394 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  35.59 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  33.59 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  34.09 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  34.75 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  34.52 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  35.22 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.64 
 
 		 380 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  34.28 
 
 		 379 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  32.94 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.65 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  34.81 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  34.03 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  36.78 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  36.78 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  32.92 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.36 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  33.17 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  32.66 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  33.77 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  33.23 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  33.17 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  35.68 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  33.17 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  34 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.59 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.54 
 
 		 383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  36.03 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  35.9 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  34.38 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  35.83 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.09 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  33.58 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  34.07 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  37.25 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  35.16 
 
 		 395 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  33.75 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  35.16 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  33.42 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.2 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.66 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.33 
 
 		 381 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  36.03 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  31.57 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  33.83 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  33.07 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  32.02 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  33.43 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.31 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  33.24 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  36.57 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  33.43 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.84 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  33.43 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  33.43 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  34.13 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  33.59 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  34.04 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  32.9 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.65 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  33.59 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  36.36 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  31.91 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  34.56 
 
 		 394 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  32.89 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  32.68 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  35.31 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.62 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  36.71 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  35.01 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  32.8 
 
 		 375 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  35.01 
 
 		 392 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  35.16 
 
 		 389 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>