More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0146 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  94.85 
 
 		 291 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  85.57 
 
 		 291 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  67.36 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  42.6 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.31 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0998  inner-membrane translocator  42.39 
 
 		 524 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1394  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 524 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22997  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1673  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.78 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2417  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2204  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 527 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 527 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3380  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 526 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.92 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4423  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0941  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 534 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1822  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.564217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1309  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.71 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1596  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.36 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1044  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1774  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.682783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1085  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.2 
 
 		 528 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.45 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.42 
 
 		 551 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  39.78 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2992  hypothetical protein  37.05 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 639 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2160  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.62 
 
 		 539 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4842  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.13 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25148  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0565  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4077  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.28 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  37.45 
 
 		 542 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5669  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.81 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.993543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3499  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 526 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1256  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.97 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0765921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3733  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4635  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4720  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 484 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149683  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4899  urea ABC transporter, permease protein UrtB  41.13 
 
 		 495 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 547 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.55 
 
 		 523 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0221  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.29 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6649  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.0600103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.18 
 
 		 545 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.43 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5696  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0633933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 551 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1710  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.01 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2177  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39.78 
 
 		 540 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0731  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 538 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0589  inner-membrane translocator  40 
 
 		 500 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.892329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4185  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 537 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.940988  normal  0.195326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2974  putative branched-chain amino acid transport system permease protein  34.06 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.23 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3062  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.63 
 
 		 550 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0700  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2049  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 538 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0994  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 642 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4634  urea ABC transporter, permease protein UrtB  40.38 
 
 		 495 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23273  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2564  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 540 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 548 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.71 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.56 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  36.07 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4427  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 529 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483913  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3128  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 542 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2483  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.66 
 
 		 540 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3104  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 542 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3144  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.93 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0786  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 539 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4886  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.75 
 
 		 529 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3317  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.29 
 
 		 545 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321889  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0879  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.11 
 
 		 539 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0797  urea ABC transporter, permease protein UrtB  38.29 
 
 		 539 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2696  inner-membrane translocator  40 
 
 		 554 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.665567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  37.82 
 
 		 558 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0430  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 539 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3068  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 542 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0909  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 539 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 540 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  39.25 
 
 		 539 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1256  branched-chain amino acid ABC transporter, permease component  35.29 
 
 		 543 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.897203  normal  0.359191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>