12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0095 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0095    100 
 
 
363 bp  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  84.64 
 
 
1524 bp  230  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  84.64 
 
 
1521 bp  230  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  84.31 
 
 
1524 bp  222  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  82.79 
 
 
1521 bp  129  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  80.47 
 
 
1518 bp  125  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  79.14 
 
 
1515 bp  87.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  90.77 
 
 
1524 bp  81.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  87.14 
 
 
630 bp  67.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  85.71 
 
 
1524 bp  60  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  93.55 
 
 
1524 bp  46.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  84.13 
 
 
1566 bp  46.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>