More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0070 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0070  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
428 aa  836    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.05 
 
 
430 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  39.31 
 
 
440 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  37.62 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  38.74 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.7 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  40.05 
 
 
430 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.7 
 
 
436 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.05 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  38.81 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.46 
 
 
436 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.05 
 
 
435 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  38.81 
 
 
435 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  38.81 
 
 
435 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
430 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
430 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
430 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
430 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
430 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
430 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  38.81 
 
 
417 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  40.05 
 
 
428 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  37.47 
 
 
430 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2930  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 
425 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 
424 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  38.64 
 
 
461 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  38.37 
 
 
435 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
443 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  39.7 
 
 
436 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  38.24 
 
 
440 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 
427 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  38.73 
 
 
428 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  39.32 
 
 
428 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  39.32 
 
 
428 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
438 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  39.42 
 
 
438 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  40.44 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  39.81 
 
 
428 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  40.19 
 
 
428 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
438 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  38.5 
 
 
442 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  35.6 
 
 
425 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
443 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.01 
 
 
447 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  38.72 
 
 
449 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  40.35 
 
 
439 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  39.04 
 
 
439 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
444 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
457 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.6 
 
 
454 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  36.91 
 
 
438 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  36.66 
 
 
438 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  36.66 
 
 
438 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.3 
 
 
452 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.4 
 
 
435 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  37.35 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  36.41 
 
 
438 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  37.25 
 
 
440 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
439 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  37.74 
 
 
434 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
439 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  36.6 
 
 
425 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  36.63 
 
 
438 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  35.37 
 
 
436 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.78 
 
 
425 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  37.86 
 
 
499 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  36.12 
 
 
437 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
429 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  36.2 
 
 
431 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  38.73 
 
 
427 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  35.18 
 
 
438 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  37.03 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  35.87 
 
 
447 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  36.7 
 
 
425 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
425 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  35.34 
 
 
432 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  36.36 
 
 
425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  35.9 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  35.9 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  35.9 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  36.52 
 
 
425 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  36.62 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  36.63 
 
 
433 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4150  major facilitator transporter  36.54 
 
 
431 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023959  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  36.39 
 
 
440 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 
433 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
445 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
445 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  36.7 
 
 
445 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  34.46 
 
 
437 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  35.68 
 
 
443 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  34.46 
 
 
437 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  35.44 
 
 
443 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  35.44 
 
 
443 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  35.44 
 
 
443 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  34.12 
 
 
442 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>