215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0068 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 332 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  36.72 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  38.51 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  33.99 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  33.66 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  34.64 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  34.97 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  34.65 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  34.98 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  34.98 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  34.98 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  35.29 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  34.32 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  34.87 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  34.65 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  34.65 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  34.1 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  34.32 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  35.06 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  35.05 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  32.8 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.21 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  33.33 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  34.1 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  31.89 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  30.56 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  33.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  28.85 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  30.09 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  29.77 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  31.82 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  28.9 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  31.35 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  29.93 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  30.29 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.52 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  30.49 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  30.84 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  29.97 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  28.24 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  30.84 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  30.62 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  27.91 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  30.36 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  33.48 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.58 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  30.64 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  33.19 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  27.27 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  30.25 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  31.32 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  31.2 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  32.5 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  30.25 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.96 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.24 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.2 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.45 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.52 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.96 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.03 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  29.15 
 
 		 379 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  31.1 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  31.95 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  32.97 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.23 
 
 		 444 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.47 
 
 		 602 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.93 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  26.53 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  26.47 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.52 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  27.73 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  32.42 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  27.21 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.6 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  27.21 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  31.44 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  30.77 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  30.93 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  30.93 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  30.93 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  30.41 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  26.86 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.74 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.68 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  29.22 
 
 		 419 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.64 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.3 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>