212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0057 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  60.56 
 
 		 570 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0057  urease subunit alpha  100 
 
 		 571 aa  1156    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  60.56 
 
 		 570 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  60.74 
 
 		 570 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6189  urease subunit alpha  60.74 
 
 		 570 aa  666    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0698012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  63.92 
 
 		 571 aa  737    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  60.39 
 
 		 570 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  60.74 
 
 		 569 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  55.96 
 
 		 566 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1474  urease subunit alpha  52.53 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34218  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  55.85 
 
 		 571 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4835  urease subunit alpha  52.01 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  56.72 
 
 		 571 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  53.5 
 
 		 878 aa  605  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  52.36 
 
 		 572 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  54.62 
 
 		 569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  53.16 
 
 		 567 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  55.85 
 
 		 568 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  54.28 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3662  urease subunit alpha  51.66 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3504  urease, alpha subunit  57.14 
 
 		 572 aa  601  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7009  urease subunit alpha  52.26 
 
 		 571 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6441  urease subunit alpha  54.15 
 
 		 577 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.170018  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  52.71 
 
 		 573 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  54.1 
 
 		 568 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  53.86 
 
 		 568 aa  594  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  54.17 
 
 		 572 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  53.05 
 
 		 573 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  52.61 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  54.26 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0191  urease, alpha subunit  54.62 
 
 		 573 aa  589  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0580  urease subunit alpha  54.21 
 
 		 566 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09880  urease subunit alpha  54.74 
 
 		 566 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  54.04 
 
 		 568 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3204  urease, alpha subunit  53.83 
 
 		 574 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00573416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1558  urease, alpha subunit  53.59 
 
 		 568 aa  591  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29811  urease subunit alpha  53.38 
 
 		 574 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0392  urease subunit alpha  50.94 
 
 		 585 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  52.63 
 
 		 567 aa  591  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2627  urease subunit alpha  54.28 
 
 		 569 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0832  urease subunit alpha  55.03 
 
 		 575 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  52.26 
 
 		 570 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  51.22 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  52.45 
 
 		 575 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0506  urease subunit alpha  53.67 
 
 		 565 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  51.57 
 
 		 570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  53.14 
 
 		 571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4895  urease, alpha subunit  53.68 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  53.4 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4436  urease subunit alpha  53.51 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  53.93 
 
 		 569 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  53.05 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3692  urease subunit alpha  51.57 
 
 		 570 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3500  urease subunit alpha  51.74 
 
 		 570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  55.32 
 
 		 568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  51.57 
 
 		 570 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  52.36 
 
 		 569 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2755  urease, alpha subunit  54.77 
 
 		 572 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0640489  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2184  urease subunit alpha  54.42 
 
 		 572 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114841 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19261  urease subunit alpha  53.05 
 
 		 569 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3352  urease subunit alpha  54.45 
 
 		 573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.669809  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  51.57 
 
 		 570 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0692  urease subunit alpha  54.04 
 
 		 566 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.969236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  53.93 
 
 		 568 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  53.05 
 
 		 569 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2257  urease subunit alpha  53.58 
 
 		 569 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0836  urease subunit alpha  51.13 
 
 		 569 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3939  urease subunit alpha  54.44 
 
 		 583 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  53.78 
 
 		 564 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1803  urease subunit alpha  51.74 
 
 		 570 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659823  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1767  urease subunit alpha  54.1 
 
 		 567 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  53.68 
 
 		 567 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  53.51 
 
 		 570 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  52.62 
 
 		 572 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  52.09 
 
 		 570 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1861  urease subunit alpha  54.42 
 
 		 572 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  51.05 
 
 		 570 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3082  urease subunit alpha  54.26 
 
 		 573 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0821561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0723  urease subunit alpha  53.93 
 
 		 568 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08951  urease subunit alpha  51.48 
 
 		 569 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  52.45 
 
 		 572 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2557  urease subunit alpha  53.93 
 
 		 568 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  52.27 
 
 		 572 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  53.05 
 
 		 568 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2057  urease subunit alpha  53.93 
 
 		 568 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  53.23 
 
 		 568 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  50.96 
 
 		 570 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  53.73 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1752  urease subunit alpha  51.31 
 
 		 569 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  50 
 
 		 576 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2441  urease subunit alpha  53.6 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3076  urease subunit alpha  53.75 
 
 		 568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  52.88 
 
 		 568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>