More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0054 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  100 
 
 
604 aa  1204    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  54.05 
 
 
620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  53.7 
 
 
616 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  52.27 
 
 
585 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  51.75 
 
 
585 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  54.01 
 
 
583 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  53.67 
 
 
601 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  32.43 
 
 
582 aa  250  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  31.11 
 
 
621 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.14 
 
 
852 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.68 
 
 
594 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  29.48 
 
 
594 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.18 
 
 
838 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  29.19 
 
 
594 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  29.19 
 
 
594 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  29.35 
 
 
594 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  29.42 
 
 
594 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  29.35 
 
 
594 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31 
 
 
632 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  29.19 
 
 
594 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  30.28 
 
 
589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  28.19 
 
 
603 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.67 
 
 
594 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  28.69 
 
 
594 aa  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  29.64 
 
 
598 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 
594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  30.26 
 
 
590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30 
 
 
594 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  29.23 
 
 
625 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  31.55 
 
 
840 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.94 
 
 
609 aa  206  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  28.15 
 
 
589 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.11 
 
 
950 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  28.4 
 
 
606 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  30.85 
 
 
604 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  28.74 
 
 
593 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  29.17 
 
 
597 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  28.42 
 
 
590 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  30 
 
 
603 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  28.06 
 
 
593 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  29.2 
 
 
608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  27.93 
 
 
616 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  29.02 
 
 
589 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  29.25 
 
 
617 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  29.01 
 
 
590 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  28.37 
 
 
842 aa  198  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  27.13 
 
 
593 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  28.72 
 
 
589 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  29.72 
 
 
613 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  29.15 
 
 
597 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  32.75 
 
 
840 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  29.87 
 
 
599 aa  195  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  28.5 
 
 
840 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  28.97 
 
 
608 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  28.05 
 
 
589 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  30.99 
 
 
614 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  28.97 
 
 
608 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  30.46 
 
 
859 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  30.69 
 
 
830 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  28.98 
 
 
594 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  29.12 
 
 
590 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  26.72 
 
 
599 aa  191  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  31.2 
 
 
827 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  31.34 
 
 
823 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  30.37 
 
 
954 aa  190  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  30.48 
 
 
863 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  31.18 
 
 
610 aa  188  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  29.63 
 
 
597 aa  187  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  30.8 
 
 
823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  28.92 
 
 
593 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_003296  RS01743  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  29.64 
 
 
608 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.933638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  29.55 
 
 
631 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  28.79 
 
 
588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0997  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.31 
 
 
596 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  27.23 
 
 
606 aa  180  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  27.98 
 
 
565 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  27.5 
 
 
951 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  29.65 
 
 
616 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  28 
 
 
660 aa  177  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  28.37 
 
 
608 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  27.68 
 
 
595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  27.49 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  28.34 
 
 
630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  29.88 
 
 
822 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3953  ABC transporter related  29.26 
 
 
625 aa  173  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594442  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  28.35 
 
 
832 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  28.65 
 
 
604 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  29.18 
 
 
586 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  28.01 
 
 
612 aa  171  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  25.81 
 
 
648 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  37.7 
 
 
256 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  28.45 
 
 
624 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.45 
 
 
248 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  37.21 
 
 
260 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>