More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0038 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  787    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  67.77 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  72.19 
 
 		 411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  70.79 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  69.54 
 
 		 398 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  74.26 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  68.97 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  65.71 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  63.84 
 
 		 410 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  66.94 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  65.07 
 
 		 408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  65.76 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  68.26 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  68.26 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  57.26 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  63.52 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 402 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  59.11 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  58.68 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  60.89 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  55.3 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  52.08 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  56.35 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  56.13 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  47.64 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  50.27 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 401 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 403 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 403 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 400 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 408 aa  269  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  41.19 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  46.98 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  44.48 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 451 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  38.46 
 
 		 451 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  38.46 
 
 		 451 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.01 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 401 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  38.07 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.26 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  34.9 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 415 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  31.62 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 735 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  28.16 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 432 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.06 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  29.71 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  29.84 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>