9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0035 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0035    100 
 
 
887 bp  1758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  82.63 
 
 
1266 bp  250  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  82.63 
 
 
1266 bp  250  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6431    80.32 
 
 
312 bp  123  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.030456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6429    81.63 
 
 
1014 bp  52  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.125092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0294  transposase mutator type  84.38 
 
 
1311 bp  48.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4276  transposase mutator type  84.38 
 
 
1311 bp  48.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4286  transposase mutator type  84.38 
 
 
1311 bp  48.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4304  transposase mutator type  84.38 
 
 
1311 bp  48.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>