37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0017 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  69.21 
 
 
481 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  71.49 
 
 
484 aa  665    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  67.63 
 
 
483 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  68.39 
 
 
482 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  971    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  66.94 
 
 
482 aa  634    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  68.18 
 
 
482 aa  679    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  67.77 
 
 
480 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  67.15 
 
 
481 aa  633  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  65.45 
 
 
488 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  60.94 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  60.12 
 
 
494 aa  598  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  53.32 
 
 
478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  53.1 
 
 
486 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  52.58 
 
 
510 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  61.74 
 
 
412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  50.34 
 
 
489 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  30.56 
 
 
489 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  30.17 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  28.99 
 
 
487 aa  167  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  47.73 
 
 
176 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  27.79 
 
 
488 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  26.05 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.76 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  27.53 
 
 
487 aa  117  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  29.02 
 
 
538 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  23.34 
 
 
492 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  28.8 
 
 
499 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  28.49 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  26.01 
 
 
499 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  28.45 
 
 
477 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  27.65 
 
 
490 aa  60.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  23.87 
 
 
485 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  23.62 
 
 
507 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  23.42 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  21.03 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  24.9 
 
 
502 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>