19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0007 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6439  hypothetical protein  57.74 
 
 
324 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.450105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1282  hypothetical protein  60.38 
 
 
340 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2205  hypothetical protein  31.12 
 
 
330 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673181  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2692  hypothetical protein  32.95 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  28.19 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  33.53 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01954  hypothetical protein  30.22 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.091836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  31.98 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  31.98 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  31.98 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  33.14 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  31.01 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  31.01 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  31.01 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  27.57 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04711  hypothetical protein  31.97 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2275  hypothetical protein  30.56 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.137375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2168  hypothetical protein  23.2 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>